茎は地を這って広がり、赤色を帯び、ときに緑色、伏毛が生えるが、茎の裏側には毛が無い。葉は長さ4～8㎜、低い鋸歯縁、斑紋がなく、葉表には毛ないが、茎頂に近い葉の縁に毛があり、葉裏には毛がない。杯状花序の腺体は赤色、付属体は淡紅色、小さく縁取りのようで目立たない。果実は長さ約1.5㎜の3綾形であり、稜付近だけに白毛が生える。種子は長さ約0.9㎜の4綾形、不規則な横しわがある。2n=18,20
　在来種のニシキソウは毛がまばらで、果実は無毛。
　コニシキソウは葉に黒い斑紋があり、果実の全面に伏毛が生える。
　帰化種の中で果実がよく似ているのがアレチニシキソウであり、果実の稜の毛が長くて曲がり、葉裏に伏毛が密生する。