カブトゴケ属のうち、シアノバクテリアを主の共生藻とするものが藍色カブトゴケ類、緑藻を共生藻とするものが緑色カブトゴケ類と分類されている。
　共生藻類はシアノバクテリアの藍藻であり、藍色カブトゴケ類。岩上着生～樹皮着生の普通種。地衣体は中型、直径5～12㎝、褐色～暗青褐色、不規則に分裂し、裂片は幅5～10㎜。背面は網目状に凸凹になり、凸部に裂芽と小裂片がある。粉芽はない。裂芽は尾根や裂片の縁につき、小裂片状や円筒状になる。腹面は淡黄褐色、凸面がトメンタとわずかな褐色の偽根で覆われる。子器は凸面の尾根につき、直径2～4㎜、盤は褐色。胞子は紡錘形、長さ30～40µm、幅5～7µm、3隔壁。スポットテスト　皮層：K-, 髄層：K- , P- , KC-。二次代謝物質はトリテルペノイド、thelephoric acid　を含む。
　他の主な藍色カブトゴケ類は次の通り。
　アイイロカブトゴケ Lobaria isidiosa　東アジアに広く分布する。藍藻類が共生し、乾くと褐色～暗褐色、湿ると青緑色。粉芽を欠く。扁平～円筒状の裂芽と小裂片が縁に沿ってある。 子器は尾根につき、直径2～3㎜、褐色。胞子は紡錘形 、3隔壁、長さ25～30µm、幅10～12µm。髄層：K+赤色, P+橙色, KC-。ジロフォール酸、コンスチクト酸、スチクチン酸、ノルスチクチン酸、テレフォール酸を含む。
　ホソバカブトゴケモドキ Lobaria pseudopulmonaria 東アジア、アラスカに分布し、アイイイロカブトゴケに似て小裂片がある。胞子は紡錘形、長さ約27µm、幅7～8µm。constictic acid 、ノルスチクチン酸、スチクチン酸、 レチゲル酸、レチゲル酸A、 レチゲル酸B、thelophoric acid 、retigeradiol を含む。
　カブトゴケモドキ Lobaria kurokawae は日本、朝鮮、中国、台湾、ネパール、インドネシア、アラスカに分布し、褐色～暗緑色。粉芽や裂芽を欠く。子器は直径2～3㎜。胞子は無色、紡錘形、3隔壁、長さ約20µm、幅約8µm。エルゴステロール、 stictan-3β, 22α-diol 、 レチゲル酸B、レチゲル酸A、オルセリン酸エチル、3- O -methyl-1,2: 5,6-bis-O-(1 -mehtylethylidene)- d-chiro- inostiol を含む。
　ツブカブトゴケモドキ Lobaria retigera var. subisidiosa は本州、四国の稀産種。K+黄～赤色 , P+黄色 , KC-。スチクチン酸又はノルスチクチン酸を含む。

　緑色カブトゴケ類の主なものは次のとおり
　ナメラカブトゴケLobaria orientalis 、ヘラガタカブトゴケ Lobaria spathulata、チヂレカブトゴケ Lobaria isidiophora 、コナカブトゴケ Lobaria pulmonaria、テリハカブトゴケLobaria meridiona、ツブカブトゴケ Lobaria tuberculata 、ウスバカブトゴケ　Lobaria linita、チヂレカブトゴケLobaria isidiophora、カラフトカブトゴケ Lobaria sachalinensis、トゲカブトゴケ Lobaria kazawaensis