子器が地衣体に埋没～半埋没し、非常に細長く、よく分岐するのが特徴。
　地衣体は薄く、平滑、灰白色、子器が初期には埋没し、半埋没、長さ1～3 (4)㎜、幅0.05～0.15㎜（長さ3～10㎜、幅0.1～0.2㎜）、よく分岐する。子器断面は果殻が下部まで炭化し、底部は開く（D型）。子嚢層は厚さ 50～100 µm。子嚢は胞子を8個入れる。胞子は長さ20～35µｍ、幅5～7µm、6～8(10)室 。スポットテストは(-)。二次代謝物質は検出されない。
　モジゴケ Graphis scriptaは子器が埋没し、地衣体からやや持ち上がり、屈曲し、長さ1～3㎜、幅0.2～0.4㎜、分岐は少ない。
　子器がよく分岐するモジゴケ類は次のとおり。
　エダマタモジゴケ Graphis desquamescens は子器が突出し、長さ0.5～3㎜、幅0.15～0.2㎜、ホソモジゴケより子器の幅が広く、よく分岐し、子器が黒く見える。
　ニセモジゴケ Graphis handelii は子器が地衣体に埋没し、長さ1～3.5㎜、幅0.1～0.25㎜、線形、まれに分枝（盛んに分岐するともいわれている）。子器断面はD型。胞子は長さ21～30µm、6～8室。K+赤色 , P+黄色。ノルスチクチン酸含有。