細長い根茎を横に伸ばし、まばらに叢生する。茎は三稜形、ざらつく。葉は幅2～4㎜、裏面はやや粉白色。小穂は長い柄があり、2～4個つく。頂小穂は雄性、長さ1.5～3㎝の線形。雌性の側小穂は、長さ1～2㎝、幅6～7㎜の円柱状。花期には小穂は直立し、果期には垂れ下がる。花期に雌小穂から長い柱頭が突き出しているのが特徴であり、花後も残る。果胞は長さ3.5～4㎜、長い嘴があり、嘴の先に微刺（やや不明瞭な果胞もある。）があり、口部は2歯。雌鱗片は果胞よりやや短く鋭尖頭。果実は長さ約2㎜の3稜のある倒卵形、柱頭は3岐。2n=62
　エナシヒゴクサは側小穂に柄がほとんどなく、側小穂が果期にも直立し、柱頭がヒゴクサほど長くならず、花後に早く落ちる。果胞の嘴もやや短く、小刺がない。
　ヒメシラスゲは小穂にほとんど柄がなく、茎の上部に小穂が集まり、直立し、果期には側小穂が開出する。柱頭は短い。