茎は匍匐してランナーのように茎が伸びる。仮根は褐色。匍匐茎と直立茎の2形あり、写真は直立茎。葉は長さ2～3.5㎜の卵形、先が尖る。葉縁には明瞭な舷があり、葉の上半部に鋭い歯がある。若い枝葉は全縁。葉の基部は茎に下垂して、翼となる。中肋は太く、葉先に達する。葉身細胞は長さ15～30（35）μmの不規則な六角形、薄壁～ときにやや厚壁。雌雄同株。蒴柄は長さ2～3㎝、黄赤色。蒴は長卵形、垂れ下がる。n=12
　コツボゴケはやや小形で、雌雄異株。また、葉身細胞の大きさがより均等。