世界中の熱帯～温帯に広く帰化している。日本では水田の雑草となっている。
　全草無毛で、茎は4稜形、直立してよく枝分かれする。葉は十字対生し、長さ3～8㎝の披針形で、基部が耳状に張り出す。花は葉腋に2～5個束生し、直径約4㎜の紅紫色の4弁花。花柄は太く、長さ1～2㎜と短い。蒴果は始め萼筒内にあり、次第に膨らみ、赤褐色、球形となって、頭を萼から露出するようになる。蒴果は直径3.5～5㎜、熟すと不規則に裂ける。2n=66
　ナンゴクヒメミソハギ Ammannia auriculata はホソバヒメミソハギに似ていて、全体に華奢、茎の稜に翼があり、花柄が長さ3～10㎜、小花柄が長さ2～5㎜と細くて長い。蒴果が直径1.5～3.5㎜と小さく、長い花柱が目立つ。
　在来のヒメミソハギは葉があまり長くならず、花が小さく、花弁がごく小さい。