葉は長さ2.5～7㎝、幅2～6㎝、卵形～長卵形、普通3裂するが、変化も多い。葉柄は長さ2.5～6㎝。花が小さいアサガオで、直径15㎜程度、1花茎に1～5個の花がつく。花冠は長さ1.5～2㎝の狭い鐘形、淡紅色、中心部が濃色になる。花冠を上から見ると５角形。小花柄にいぼ状の低い突起がある。萼片は長さ5～8㎜、やや不同長、先が尖る。果実はほぼ球形で、熟しても萼は平開しない。種子は長さ約3.5㎜、熟すと黒くなり、球を4個分割した形で、1つの果実に4個入る。2n=30
　同じように花の小さなマメアサガオは花色が白色。
　マメアサガオの別品種であるベニバナマメアサガオは淡紅色で、中心部が濃紅色にならない。これらは花柄のいぼ状の突起が高く、はっきりわかる。また、果実が扁平球形であり、種子が大きい。