茎は直立し、細く、他のギシギシより外観は弱々しい。根生葉は花期にはない。茎葉は長さ(5）10～30㎝、幅2.5～6㎝、やや薄く、長楕円状披針形、長い柄があり、縁は波打ち、鋭頭（鈍頭）、基部は浅い心形。葉の中央脈に平行して数本の脈状の隆起線が目立つことが多い。上部の葉ほど小さくなり、苞葉となる。花期はナガバギシギシよりやや遅い。花茎は枝別れして節間が長く、節ごとに密生して花を輪生する。小花梗は長さ1～4(5)㎜。花は小さく、内花被は長さ2～3㎜、1～1.6(2)㎜。果実（痩果）はギシギシの中で最も小さく、果実を包む3個の内花被は長卵形、全縁、中央のこぶ状突起も、赤色を帯びることが多い。果実は長さ1.5～2㎜、幅1～1.6（2）㎜、暗褐色。2n=20
　ギシギシは果実の内花被に浅い鋸歯がある。ナガバギシギシは果実の内花被の幅が広く、広卵形、全縁。エゾノギシギシは果実の内花被の縁に長く突き出た突起がある。