匍匐茎は長さ4～6㎝、黄褐色の仮根が密生し、葉はほぼ扁平につく。葉は長さ4～8㎜、幅2～8㎜、卵形～惰円形、微凸頭で、中肋は葉の先まで届く。葉縁の舷は細長い3～6細胞列。葉縁の歯は全周にあり、単細胞で低く不明瞭なときもある。葉身の細胞は長さ50～60μmの六角形。細胞壁は薄い。雌雄異株。雄植物には雄花盤ができる。蒴柄は長さ2～3㎝。蒴は下垂し、蓋には長い嘴がつく。蒴歯は2列。シリア（内蒴歯の歯間の毛）は3個。胞子は直径20～25μm。n=6,7
　ツルチョウチンゴケは葉が長さ5～6㎜の舌形、葉先が凹頭になるときもある。葉縁の舷が2～4細胞列で、葉身細胞が小さく、長さ15～25μmの丸みのある方形。
　アツバチョウチンゴケは葉が長さ1㎝と大きく、葉身細胞も大きく、葉縁の舷は2～3細胞列で不明瞭。葉縁の歯が1～3細胞で明瞭。
　コツボゴケやヤマトチョウチンゴケは葉先が鋭頭。