新分類(APGⅢ)ではゴマノハグサ科(Scrophulariaceae）からハエドクソウ科に移された。
　茎は分枝せず、直立又は斜上する。葉は対生し、長さ2.5～6㎝、幅1～3㎝の卵形～卵円形、10対程度の鋸歯があり、葉の基部は円形、無柄。 葉脈は平行脈。花は上部の葉腋に数個つき、長さ約2㎝の長い花柄がある。花は黄色、直径2.5～3㎝、長さ約3㎝。花冠はラッパ形、上唇は2裂し、下唇は3裂する。花冠内部に赤褐色の斑点がある。雄しべ4個。雌しべ1個。蒴果は長楕円形。
　三河地方に分布するミゾホオズキは全体に小型で、葉に長い柄があり、鋸歯が粗く、数も少ない。花冠の裂片の幅が狭い。
　ミゾホオズキ属の大部分はアメリカ大陸にあり、中でもニオイミゾホオズキ Erythranthe moschata (Dougl. ex Lindl.) G.L.Nesomは分布域が広い。muskflowerと呼ばれ、ムスクの香りがする。