日本に生育するミゾハギ属はミソハギとエゾミソハギの2種である。どちらも、よく栽培されており、自生は少ないものと思われる。
　エゾミソハギは茎、葉、萼など全体に短毛が生える。葉は対生又は3個、輪生し、長さ2～10㎝、幅5～15㎜の披針形、全縁、基部は茎を抱く。花は10～40㎝の穂状花序に多数つく。花は直径1～2㎝、紅紫色、花弁は(4)5～6(7)個。雄しべは12個。花柱の長さが違う3typeの花がある。花托筒 hypanthium （花冠と萼が融合した花筒）は長さ4～6㎜、8～12稜がある。萼片は6個、直立し、萼片の間に尾状の付属体があり、直立する。蒴果は長さ3～4㎜、幅約2㎜の卵形、熟すと2裂し、さらに2裂する。2n=30
　ミソハギは全体に無毛で、葉の基部は茎を抱かず、萼片の付属体が開出する。